干旱区生态环境知识资源中心(Arid): 柠条干旱胁迫转录组数据分析以及基因功能验证

Arid

	柠条干旱胁迫转录组数据分析以及基因功能验证
	杨杞; 韩晓敏; 于秀敏; 赵娜; 王光霞; 万永青; 杨飞芸; 张燕娜; 冯宗琪; 李娜; 毛铭铢; 郑如玉; 滑璐玢; 刘坤; 岳文冉; 王瑞刚; 李国婧
英文摘要	柠条是柠条锦鸡儿(Caragana korshinskii)、中间锦鸡儿(Caragana intermedia)和小叶锦鸡儿(Caragana microphylla)的统称,属于豆科锦鸡儿属多年生灌木,是干旱草原、荒漠草原地带的优良固沙和水土保持植物,具有很高的生态价值和经济价值。本实验室综合利用二代测序技对干旱处理后0h、1h、3h和12h的中间锦鸡儿幼苗进行转录组深度测序,结果如下:1.得到1271条共差异表达序列(ESTs),其中上调表达766条,下调表达505条,对部分Unigenes的qRT-PCR检测结果证明转录组结果可靠。2.从差异表达ESTs中筛选到404个SSR标记,并从中筛选出多态性高、重复性好的引物7对。3.对NAC、MYB、WRKY、bHLH、AP2等转录因子家族和LEA、泛素连接酶、PP2C、黄酮代谢途径酶类、DUF等功能基因家族成员与豆科植物以及模式植物拟南芥的聚类分析显示,柠条的干旱诱导表达基因与蒺藜苜蓿、鹰嘴豆、百脉根等物种的同源基因更相似。4.以模式植物拟南芥为转化系统,对上述基因家族部分成员的功能分析表明:绝大多数基因参与了对干旱、盐、衰老等的抗性(Xiaomin Han et al,BMC Plant Biology;Qi Yang et al,Molecular Biology Reports;杨杞等,林业科学;赵娜,硕士毕业论文;王光霞,博士毕业论文;于秀敏,博士毕业论文)。
英文关键词	柠条转录组功能分析转录因子基因家族
来源出版物	“农业健康与环境”组学大数据整合生物信息学研讨会论文集
出版年	2017
页码	1
中图法分类号	S793.3;Q943.2
资源类型	会议论文
条目标识符	http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/372952
作者单位	内蒙古农业大学生命科学学院
推荐引用方式 GB/T 7714	杨杞,韩晓敏,于秀敏,等. 柠条干旱胁迫转录组数据分析以及基因功能验证[C],2017:1.