Knowledge Resource Center for Ecological Environment in Arid Area
| 珍稀泌盐植物长叶红砂两个WRKY转录因子的克隆及表达分析 | |
| 王佳; 王迎春 | |
| 英文摘要 | 长叶红砂(Reaumuria trigyna),属于柽柳科(Tamaricaceae)琵琶柴属(Reaumuria),又名黄花红砂、黄花琵琶柴,起源于第三纪,为古地中海孑遗植物,所以被称为"活化石",被列为内蒙古自治区重点保护植物,其对盐碱和干旱等极端环境具有极强的适应性,是荒漠草原和干草原地区的重要生态屏障和良好草场。本实验室利用Illumina测序技术对正常生长和盐胁迫的长叶红砂进行转录组测序,获得了该植物的大量遗传信息,通过数据分析发现64694条Unigenes在盐胁迫后的表达量发生了变化,其中67条Unigene片段属于WRKY转录因子家族。根据长叶红砂转录组数据信息,选取在盐胁迫处理后表达上调明显且注释结果为WRKY转录因子的两个cDNA片段。通过cDNA末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE),从长叶红砂中克隆获得2个WRKY基因。在NCBI数据库比对与拟南芥AtWRKY33同源性分别为79%和87%,因此命名为RtWRKY33-1和RtWRKY33-2。其中RtWRKY33-1的cDNA全长2163bp,开放阅读框(Open reading frame,ORF)长度为1681bp,编码573个氨基酸;RtWRKY33-2的cDNA全长2155bp,开放阅读框长度为1776bp,编码591个氨基酸。氨基酸序列分析表明这两个基因均具有两个WRKY结构域,属于典型的I类WRKY转录因子。蛋白结构预测分析发现,两个蛋白的一级结构和二级结构在WRKY结构域的氨基酸序列和结构特性的相似性较高,但是在非保守结构域部分,尤其是N末端(1～80aa之间)、第1个WRKY结构域之前(190～240aa之间)和两个WRKY结构域之间(430～450aa之间)等位置的差异明显,可能对两个基因功能有一定影响。半定量RT-PCR分析表明,4种非生物胁迫均能诱导这两个基因的表达,但是盐、冷和ABA对RtWRKY33-2诱导尤为明显,同时RtWRKY33-2对干旱胁迫的响应更快,因此这两个基因在长叶红砂抵御非生物胁迫的应答反应中发挥的作用可能不同。本研究为深入探索WRKY33转录因子在长叶红砂中的作用机制奠定了基础。 |
| 英文关键词 | 长叶红砂 WRKY转录因子 克隆 表达分析 |
| 来源出版物 | 生态文明建设中的植物学：现在与未来——中国植物学会第十五届会员代表大会暨八十周年学术年会论文集——第3分会场：植物分子生物学与基因组学 |
| 出版年 | 2013 |
| 页码 | 1 |
| 中图法分类号 | S793.9;Q943 |
| 资源类型 | 会议论文 |
| 条目标识符 | http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/372462 |
| 作者单位 | 内蒙古大学生命科学学院 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 王佳,王迎春. 珍稀泌盐植物长叶红砂两个WRKY转录因子的克隆及表达分析[C],2013:1. |
| 条目包含的文件 | 条目无相关文件。 | |||||
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