Knowledge Resource Center for Ecological Environment in Arid Area
| 基于trnL-F和trnD-T序列的北沙柳遗传多样性及系统进化 | |
| 李娅翔 | |
| 出版年 | 2020 |
| 学位类型 | 硕士 |
| 学位授予单位 | 内蒙古农业大学 |
| 中文摘要 | 北沙柳(Salix psammophila)分布于毛乌素沙地及库布齐沙漠,是中国西北地区重要的防风固沙和植被恢复的优良树种,具有重要的生态和生产应用价值。本文以国家沙柳种质资源库内16个居群339个个体为实验材料,通过对cpDNA非编码区(trnL-F和trnD-T)测序,分析了单倍型类型,计算了北沙柳居群的遗传多样性及遗传结构,推测了单倍型间的亲缘关系,探讨了居群动态历史。主要结果如下:(1)获得北沙柳叶绿体非编码区序列trnL-F序列长965 bp,有6个变异位点,发现9种单倍型,单倍型多样性为0.645,核苷酸多样性为0.00091;trnD-T序列长846 bp,有6个变异位点6种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.530和0.00013;trnL-F和trnD-T联合序列长1811 bp,有12个变异位点16个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.737和0.00107。(2)北沙柳具有较高的遗传多样性(trnL-F:HT=0.650,Hs=0.603;trnD-T:HT=0.530,Hs=0.488;联合:HT=0.742,Hs=0.700),但居群总遗传多样性高于居群内平均遗传多样性。AMOVA分析显示,北沙柳遗传变异主要发生在居群内(trnL-F:90.67%;trnD-T:91.57%;联合:91.16%),居群间遗传分化较低(trnL-F:GST=0.072;trnD-T:GST=0.079;联合:GST=0.0565)。(3)北沙柳叶绿体基因单倍型网络图呈辐射状分布,单倍型L3(trnL-F:L3=191个)、D3(trnD-T:D3=226个)、H3(联合:H3=163个)均居于各自网络图的中心位置,是北沙柳的原始单倍型和优势单倍型。单倍型网络图的分组与系统进化树分组相一致。(4)基于cpDNA非编码区(trnL-F和trnD-T)数据的Permut计算结果显示,无论是单个序列还是联合序列,都没有谱系地理结构;Mantel测试结果表明,居群间的遗传距离和地理距离无显著相关性(trnL-F:r=-0.55544,P=1;trnD-T:r=0.20699,P=0.171;联合:r=-0.31712,P=0.951);中性检验及失配分析均显示北沙柳近期没有发生扩张。 |
| 中文关键词 | 北沙柳 ; 叶绿体基因 ; 遗传多样性 ; 遗传结构 ; 系统进化 |
| 语种 | 中文 |
| 国家 | 中国 |
| 中图法分类号 | S793.9 |
| 来源机构 | 内蒙古农业大学 |
| 资源类型 | 学位论文 |
| 条目标识符 | http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/338308 |
| 作者单位 | 内蒙古农业大学 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 李娅翔. 基于trnL-F和trnD-T序列的北沙柳遗传多样性及系统进化[D]. 内蒙古农业大学,2020. |
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