干旱区生态环境知识资源中心(Arid): 基于cpDNA非编码序列的北沙柳遗传多样性分析

Arid

	基于cpDNA非编码序列的北沙柳遗传多样性分析
其他题名	Genetic Diversity of Salix psammophila Based on cpDNA Non-coding Sequence
	李娅翔; 路东晔; 郝蕾; 张国盛; 宁静; 乌兰娜日; 阿拉腾苏和
来源期刊	西北植物学报
ISSN	1000-4025
出版年	2020
卷号	40 期号:3 页码:413-424
中文摘要	为揭示北沙柳(Salix psammophila)的遗传多样性、遗传结构及分化特征,利用叶绿体非编码区序列(trnLtrnF和trnD-trnT)对分布于毛乌素沙地和库布齐沙漠的16个北沙柳居群(339个个体)进行了遗传研究,为北沙柳种子资源库遗传管理、遗传改良、遗传育种及品种选育提供理论依据。结果表明:(1)经trnL-trnF和trnD-trnT片段联合比对获得了1 811bp序列,共有12个核苷酸变异位点(8个简约信息位点,4个变异位点),得到16个单倍型。(2)单倍型多样性指数(H_d)为0.737,核苷酸多样性指数(pi)为0.001 07;且单倍型H3的分布在所有居群中位于单倍型网络图中心,其余单倍型随机分布于各个居群。(3)AMOVA分析表明,北沙柳cpDNA的变异主要来源于居群内(91.16%),居群间遗传分化程度中等(FST=0.088 37),各居群间的基因交流非常频繁(N_m=2.58);遗传分化系数NST(0.085)显著大于GST(0.056,0.01
英文摘要	We used non-coding chloroplst DNA sequence(trnL-trnF and trnD-trnT)to study the genetic diversity of 16populations of Salix psammophila distributed in Mu Us Sandy land and Kubuqi deserts,which aimed to explore genetic diversity,structure and differentiation characteristics of this species.This study provide theoretical basis for genetic management,improvement,breeding and variety selection of S.psammophila.The main results showed that:(1)the length of combine sequences was 1 811bp,a total of 12nucleotide mutation sites were identified and 16haplotypes were recovered,including 8simple information sites and 4mutation sites.(2)The haplotype diversity was 0.737.The nucleotide diversity was 0.001 07.Only haplotype H3located in the center of the haplotype network map distributed in all populations,while other haplotypes were randomly distributed among the populations.(3)AMOVA analysis suggest that 91.16%of the total variation existed within population while among population variation was medium (F_(ST)= 0.088 37).The exchanging of gene between the populations was very frequent(N_m= 2.58).There is significant phylogeographic structure in population of S.psammophila.(N_(ST)=0.085,G_(ST)=0.056,0.01
中文关键词	北沙柳 ; 遗传多样性 ; 单倍型 ; 遗传结构
英文关键词	cpDNA Salix psammophila chloropast DNA genetic diversity haplotypes genetic structure
类型	Article
语种	中文
收录类别	CSCD
WOS研究方向	Genetics & Heredity
CSCD记录号	CSCD:6717000
来源机构	内蒙古农业大学
资源类型	期刊论文
条目标识符	http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/336455
作者单位	李娅翔, 内蒙古农业大学林学院, 呼和浩特, 内蒙古 010019, 中国.; 路东晔, 内蒙古农业大学林学院, 呼和浩特, 内蒙古 010019, 中国.; 张国盛, 内蒙古农业大学林学院, 呼和浩特, 内蒙古 010019, 中国.; 郝蕾, 内蒙古财经大学, 呼和浩特, 内蒙古 010070, 中国.; 宁静, 内蒙古林业科学研究院, 呼和浩特, 内蒙古 010010, 中国.; 乌兰娜日, 鄂尔多斯乌审旗林业局, 达布察克, 内蒙古 017300, 中国.; 阿拉腾苏和, 鄂尔多斯造林总场, 树林召, 内蒙古 014300, 中国.
推荐引用方式 GB/T 7714	李娅翔,路东晔,郝蕾,等. 基于cpDNA非编码序列的北沙柳遗传多样性分析[J]. 内蒙古农业大学,2020,40(3):413-424.
APA	李娅翔.,路东晔.,郝蕾.,张国盛.,宁静.,...&阿拉腾苏和.(2020).基于cpDNA非编码序列的北沙柳遗传多样性分析.西北植物学报,40(3),413-424.
MLA	李娅翔,et al."基于cpDNA非编码序列的北沙柳遗传多样性分析".西北植物学报 40.3(2020):413-424.