Knowledge Resource Center for Ecological Environment in Arid Area
| 青藏高原东部地区田鼠类物种分子鉴定及柴达木根田鼠谱系地理学研究 | |
| 其他题名 | Molecular identification of voles and phylogeography of Microtus limnophilus in the east of the Qinghai-Tibet Plateau |
| 赵贤贤 | |
| 出版年 | 2016 |
| 学位类型 | 硕士 |
| 导师 | 张同作 |
| 学位授予单位 | 中国科学院大学 |
| 中文摘要 | 青藏高原是世界生物多样性的热点地区，田鼠类物种是该地区的代表动物之一。对本地区开展田鼠类动物的分子生态学研究，为我们了解青藏高原的生物多样性形成机制提供重要的基础资料。本研究在青藏高原东部地区16个点采集到189只田鼠样品。首先，以线粒体细胞色素b基因（Cytb）为分子标记，对这些样品进行物种分子鉴定。结果显示，所采集到的田鼠样品，可以鉴定为三个物种：柴达木根田鼠（Microtus limnophilus）、青海松田鼠（Neodon fuscus）、高原松田鼠（N. irene）。柴达木根田鼠分布最广，在10个地点有分布（N=135）；青海松田鼠分布在4个地点（N=30）；高原松田鼠分布在3个地点（N=24）。三个物种之间的重合度较低，物种分类界限明确。同时，结合Cytb基因和光间受体视黄类物质结合蛋白基因（IRBP），对优势种柴达木根田鼠进行谱系地理学研究。结果表明，柴达木根田鼠有中等程度的谱系地理结构，各区域间（Cytb, 36.02%，IRBP, 29.46%）和区域内各种群间（Cytb, 41.57%; IRBP, 13.09%）有一定程度的遗传分化。Cytb基因的48个单倍型聚成4大类：黄河东部种群（LX、ZK、HN、MQ、JZ），刚察（GC），香日德（XRD）或门源（MY），大通（DT）或化隆（HL）。造成柴达木根田鼠的种群间遗传分化原因有两个，一是小型哺乳动物有限的运动迁移能力，二是青藏高原东部地区地质变化，尤其共和盆地沙漠化和黄河纵切导致的各种小生境的隔离作用。 |
| 英文摘要 | Qinghai-Tibet Plateau (QTP) is a biodiversity hotspot, and Arvicoline rodents are one of the typical animals there. Studying Arvicoline rodents on the QTP offers us important information about the mechanism of biodiversity. 189 specimens of Arvicoline rodents were sampled from 16 localities. Using mitochondrial cytochrome b gene (Cytb) we identified all the specimens. Three species were identified from all the specimens, Microtus limnophlis, Neodon fuscus and N. irene. M. limnophilus is most widely distributed, with 10 localities (N=137), followed by N. fuscus with 4 localities (N=30) and N. irene with 3 localities (N=24). The overlap of the three species is low while the three species are separated clearly. We analyzed the phylogeography of M. limnophilus, the most distributed vole in the east of QTP using mitochondrial Cytb combined with interphotoreceptor retinoid-binding protein (IRBP). The results suggest that M. limnophilus should poccess moderate phygeographic structure, with the variation percentage among groups (Cytb, 41.75%, IRBP, 29.46%) and among population within groups (Cytb, 41.57%, IRBP, 13.09%). All the 46 haplotypes could be divided into 4 groups, eastern Yellow River (LX, ZK, HN, MQ, JZ), GC, XRD or MY, DT or HL. There are two factors that separated M. limnophis, the limited moveing capacity of small mammals and the tremendous geographical shift of Qignhai-Tibet Plateau especially the desertification of Gonghe Basin and the incision of the Yellow River. |
| 中文关键词 | 田鼠类 ; 青藏高原 ; 分子鉴定 ; 谱系地理 ; 柴达木根田鼠 |
| 英文关键词 | voles Qinghai-Tibet Plateau molecular identification phylogeography Microtus limnophilus |
| 语种 | 中文 |
| 国家 | 中国 |
| 来源学科分类 | 动物学 |
| 来源机构 | 中国科学院西北高原生物研究所 |
| 资源类型 | 学位论文 |
| 条目标识符 | http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/287760 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 赵贤贤. 青藏高原东部地区田鼠类物种分子鉴定及柴达木根田鼠谱系地理学研究[D]. 中国科学院大学,2016. |
| 条目包含的文件 | 条目无相关文件。 | |||||
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