Knowledge Resource Center for Ecological Environment in Arid Area
| 基于骆驼基因组的癌症相关基因的研究 | |
| 其他题名 | Research of Cancer-Related Genes Based on Camel’s Genome |
| 张平宇 | |
| 出版年 | 2015 |
| 学位类型 | 硕士 |
| 导师 | 李亦学 |
| 学位授予单位 | 中国科学院大学 |
| 中文摘要 | 在正常细胞当中，癌症相关基因积累的突变导致其功能异常，影响相关信号通路的功能，最终导致癌细胞的产生。因而在癌症基因组的研究中，研究癌症相关基因的功能及其参与的信号通路是非常重要的。骆驼是一种生活在荒漠环境中的大型哺乳动物，为了在严酷的环境中生存，骆驼的一些生理特征和其他哺乳动物相比有明显不同。骆驼体内大量产生一种小分子物质EETs，EETs能保护血管，防止饮食中摄入大量的盐导致的高血压的产生，但会促进肿瘤的转移和血管生成。因而骆驼的癌症相关基因和其他哺乳动物相比可能会有所不同，能够抑制癌症的发生。 在本次研究中我们使用比较基因组学的方法：首先构建野生双峰骆驼和其他9种哺乳动物的直系同源单基因家族并构建这10个物种的系统发生树；然后找出野生双峰骆驼的正选择基因及其正选择位点，从中挑选出和癌症发生相关的正选择基因，并结合双峰骆驼和单峰骆驼的基因组数据挑选出可靠的正选择基因和位点；最后研究这些位点的变化与癌症的发生之间的关系。 我们的研究为癌症相关基因的功能和及其分子进化方面的研究提供了有价值的信息。 |
| 英文摘要 | Somatic mutations of cancer-related genes accumulated in normal cells cause abnormality in those genes’ function and affect the function of related signaling pathway, ultimately resulting in the generation of cancer cells. So it’s important to research the function and related signaling pathways of cancer-related genes on the research of cancer genome. Camel is a kind of large mammal living in the desert environment. In order to survive in the harsh environment, some physiological characteristics of camel are significantly different from those of other mammals. Camel’s body produces a large amount of small molecules named EETs. Although EETs can protect blood vessel from hypertension caused by high dietary intake of salt, it may promote tumor metastases and enhance angiogenesis. Thus cancer-related genes of camel may be different from those of other mammals, which can inhibit the generation of cancer. We use comparative genomics approach in this research. First, construct the ortholog single gene families of the wild Bactrian camel and nine other mammals and construct the phylogenetic tree of these ten species. Then, identify positive selected genes with positive selected sites of the wild Bactrian camel, choose cancer-related genes among these positive selected genes and identify reliable positive selected genes and positive selected sites by using the genome data of Bactrian camel and dromedary. Finally, study the relationship between variation of these sites and occurrence of cancer. Our research provides valuable information for the research on function and molecular evolution of cancer-related genes. |
| 中文关键词 | 骆驼 ; 正选择基因 ; 癌症相关基因 ; 信号通路 |
| 英文关键词 | camel positive selected gene cancer-related gene signaling pathway |
| 语种 | 中文 |
| 国家 | 中国 |
| 来源学科分类 | 生物工程 |
| 来源机构 | 中国科学院上海生命科学研究院 |
| 资源类型 | 学位论文 |
| 条目标识符 | http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/287568 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 张平宇. 基于骆驼基因组的癌症相关基因的研究[D]. 中国科学院大学,2015. |
| 条目包含的文件 | 条目无相关文件。 | |||||
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