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蚓果芥植物资源调查鉴定及ETR1序列的进化分析
郝海婷
出版年2013
学位类型硕士
导师李唯 ; 马小飞
学位授予单位甘肃农业大学
中文摘要蚓果芥是广布于我国北方干旱区的一种多年生草本植物，属十字花科，具有干旱区植物抗旱特性和适应性的特点，但有关蚓果芥的研究甚少。蚓果芥与模式植物拟南芥同科，拟南芥的研究已相对清楚，能否通过拟南芥已有的信息对蚓果芥植物进行研究与利用，是一个值得重视的问题。 根据野外实际调查和前期实验室鉴定发现，蚓果芥相对拟南芥具有更强的抗旱能力，生态可塑性较高，在植物抗逆性挖掘与利用方面具有极大的研究潜力。为此，本文以荒漠植物蚓果芥为材料，对其资源分布现状和适应性做了初步调查，应用分子技术进行分析鉴定，并利用拟南芥序列信息，选择其中的一个功能基因，结合传统软件初步分析了蚓果芥的系统发育关系和适应特性，旨在为我国蚓果芥资源开发利用奠定研究基础。主要研究结果如下： 1.结合对蚓果芥的研究文献、数据库等资料的运用，对蚓果芥进行了野外调查。共采集到群体样本17个。其中甘肃的8个，样本分别为景泰、老虎台、翠柳沟、兰山、交大后山、白虎山和红谷。其中兰山又分为2个群体，兰山A和兰山B；青海省9个样本，有北山A和北山B，日月山A-B、互助、甘地乡、共和、沙珠玉乡、兴海、麻黄沟等；除了这些地方，在山西省大同有零稀分布，而在陕西省榆林、内蒙的鄂尔多斯、包头没有发现分布。 2.以蚓果芥为材料，通过PCR测序，获得了644bp长的ITS序列，与NCBI上已登录的ITS序列同源性达到了94%，说明已成功获得了蚓果芥ITS序列，命名为BH0087。利用已测序成功的ITS序列和下载的29条ITS序列构建系统树，显示蚓果芥与Braya humilis(21)和Neotorularia brachycarpa(1)亲缘关系最近。 3.采用已报道的十字花科植物乙烯受体基因(Ethylene Receptor1, ETR1)通用引物，以蚓果芥(Braya humilis (C.A. Mey.))基因组DNA为模板，经PCR分析BhETR1的多态性，进而从分子水平上阐明蚓果芥的进化特征。结果表明，已克隆得到的14条ETR1基因序列，长度为1644~1661bp。经Bioedit软件比对，14条核苷酸序列之间相似性为93%~98%,蛋白序列相似度为87%-100%。采用DnaSP v5程序分别统计BhETR1序列多态性，发现14条BhETR1序列形成了14种单倍型。从GenBank数据库下载蚓果芥近缘物种ETR1序列进行进化分析，系统发育分析表明蚓果芥14条ETR1序列形成3大分支。根据分支进化关系，每支中分别选取克隆2(c2)、克隆29(c29)、克隆35(c35)与拟南芥(Arabidopsis thaliana (L.) Heynh) ETR1(AtETR1)序列进行比对,其一致性为80%、81%、81%；和琴叶鼠耳芥(Arabidopsis lyrata subsp.) ETR1(AlETR1)的序列进行比对，其一致性均为81％、81%、82%。说明BhETR1是一个乙烯受体类似(ETR1-like)基因，而蚓果芥自身14条序列的高度异质性表明蚓果芥的遗传背景相对复杂。
中文关键词蚓果芥 ; 植物资源调查 ; ITS序列 ; 乙烯受体 ; ETR1 ; 基因克隆 ; 进化分析
语种中文
国家中国
URLhttp://kns.cnki.net/kns/detail/detail.aspx?FileName=1014012339.nh&DbName=CMFD2014
来源机构甘肃农业大学
资源类型学位论文
条目标识符http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/254825
推荐引用方式
GB/T 7714		 郝海婷. 蚓果芥植物资源调查鉴定及ETR1序列的进化分析[D]. 甘肃农业大学,2013.
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