Knowledge Resource Center for Ecological Environment in Arid Area
| 基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析 | |
| 其他题名 | Analysis of expression profile in Karelinia caspia seedling under drought stress based on mRNA-Seq |
| 王彦芹1; 沈李丽2; 罗来鑫3; 李健强3; 李志军1 | |
| 来源期刊 | 植物生理学报
 |
| ISSN | 2095-1108 |
| 出版年 | 2018 |
| 卷号 | 54期号:5页码:879-885 |
| 中文摘要 | 以抗逆性较强的荒漠植物花花柴为材料,利用数字基因表达谱技术对用质量百分数20%的PEG溶液处理0、4、8、12和24 h后的花花柴幼苗的mRNA-Seq测序结果进行分析。结果表明,花花柴幼苗叶部在不同处理时间均上调表达的基因有122个,下调表达的基因54个,根部在不同处理时间均上调表达的基因73个,下调表达的基因79个。利用qRT-PCR和RT-PCR对可能与花花柴耐旱相关的6个差异表达基因进行了验证,发现其表达模式与表达谱结果一致,推测这些基因可能均与花花柴响应干旱胁迫相关。本研究为耐旱相关基因的发掘及应用提供了基础。 |
| 英文摘要 | In this study,the gene expression profile of Karelinia caspica seedling was used for analysis under treatment with 20% PEG at 0,4,8,12,and 24 h through mRNA-Seq technology.The results indicated that there were 122 genes up-regulated and 54 genes down-regulated expression in the leaves,and 73 genes up-regulated and 79 genes down-regulated expression in the roots of Karelinia caspica seedling under different time treatments.And then,6 genes with differential expression were tested by qRT-PCR and RT-PCR.The result showed that the expression pattern of these 6 genes were as same as the mRNA-Seq.It was inferred that these genes might be related with drought stress in Karelinia caspica.This research provides a basis for the exploration and application of drought related genes from Karelinia caspica. |
| 中文关键词 | 沙漠植物 ; 花花柴 ; 干旱胁迫 ; 耐旱相关基因 |
| 英文关键词 | mRNA-Seq desert plant Karelinia caspica drought stress mRNA-Seq drought-related genes |
| 语种 | 中文 |
| 国家 | 中国 |
| 收录类别 | CSCD |
| WOS类目 | PLANT SCIENCES |
| WOS研究方向 | Plant Sciences |
| CSCD记录号 | CSCD:6272274 |
| 来源机构 | 中国农业大学 |
| 资源类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/238619 |
| 作者单位 | 1.新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室;;塔里木大学生命科学学院, 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室;;, 阿拉尔;;阿拉尔, 新疆;;新疆 843300;;843300, 中国; 2.新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室;;中国农业大学种子病理实验室, 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室;;, 阿拉尔;;, 新疆;;北京 843300;;100193, 中国; 3.中国农业大学种子病理实验室, 北京 100193, 中国 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 王彦芹,沈李丽,罗来鑫,等. 基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析[J]. 中国农业大学,2018,54(5):879-885. |
| APA | 王彦芹,沈李丽,罗来鑫,李健强,&李志军.(2018).基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析.植物生理学报,54(5),879-885. |
| MLA | 王彦芹,et al."基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析".植物生理学报 54.5(2018):879-885. |
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