Knowledge Resource Center for Ecological Environment in Arid Area
| 疏叶骆驼刺中包含一种新杆状DNA病毒 | |
| 其他题名 | A novel endogenous badnavirus exists in Alhagi sparsifolia |
| […] | |
| 来源期刊 | 浙江大学学报. B辑, 生物医学与生物技术
 |
| ISSN | 1673-1581 |
| 出版年 | 2018 |
| 卷号 | 19期号:4页码:274-284 |
| 中文摘要 | 目的:新杆状DNA病毒的分离与鉴定。创新点:首次在高寒地区代表性植物疏叶骆驼刺中发现杆状DNA病毒,为研究杆状DNA病毒的进化、地理分布及寄主范围提供了新证据。方法:利用分段聚合酶链式反应(PCR)克隆疏叶骆驼刺杆状病毒(Alhagi bacilliform virus,ABV)的基因组序列;通过基因组分析、序列比对和进化树分析阐明ABV的进化地位;用Southern印迹杂交和反向PCR分析ABV序列与宿主基因组的关系;并通过PCR检测确定ABV在我国西北地区疏叶骆驼刺中的分布。结论:本研究获得了7068 nt的ABV基因组序列,根据基因组结构、保守序列比对及进化树分析,推测ABV是一种新杆状DNA病毒。分子检测证据表明,ABV基因组序列已整合进入疏叶骆驼刺基因组中,但没有产生游离病毒。此外,对我国西北11个不同地区的疏叶骆驼刺进行PCR检测,结果显示其中9个地区的疏叶骆驼刺均含有ABV序列,由此表明ABV在我国西北地区的疏叶骆驼刺中广泛存在。 |
| 英文摘要 | We report the recovery of a 7068-nt viral sequence from the viral fossils embedded in the genome of Alhagi sparsifolia, a typical desert plant. Although the full viral genome remains to be completed, the putative genome structure, the deduced amino acids and phylogenetic analysis unambiguously demonstrate that this viral sequence represents a novel species of the genus Badnavirus. The putative virus is tentatively termed Alhagi bacilliform virus (ABV). Southern blotting and inverse polymerase chain reaction (PCR) data indicate that the ABV-related sequence is integrated into the A. sparsifolia genome, and probably does not give rise to functional episomal virus. Molecular evidence that the ABV sequence exists widely in A. sparsifolia is also presented. To our knowledge, this is the first endogenous badnavirus identified from plants in the Gobi desert, and may provide new clues on the evolution, geographical distribution as well as the host range of the badnaviruses. |
| 中文关键词 | 杆状DNA病毒 ; 内生疏叶骆驼刺杆状病毒 ; 基因组整合 |
| 英文关键词 | Badnavirus Endogenous Alhagi bacilliform virus Nuclear integration |
| 语种 | 英语 |
| 国家 | 中国 |
| 收录类别 | CSCD |
| WOS类目 | MICROBIOLOGY |
| WOS研究方向 | Microbiology |
| CSCD记录号 | CSCD:6216810 |
| 资源类型 | 期刊论文 |
| 条目标识符 | http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/238609 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | […]. 疏叶骆驼刺中包含一种新杆状DNA病毒[J],2018,19(4):274-284. |
| APA | […].(2018).疏叶骆驼刺中包含一种新杆状DNA病毒.浙江大学学报. B辑, 生物医学与生物技术,19(4),274-284. |
| MLA | […]."疏叶骆驼刺中包含一种新杆状DNA病毒".浙江大学学报. B辑, 生物医学与生物技术 19.4(2018):274-284. |
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