干旱区生态环境知识资源中心(Arid): 沙漠小球藻的蛋白双向电泳分析

Arid

	沙漠小球藻的蛋白双向电泳分析
其他题名	Analysis of Two-dimensional Electrophoresis Protocol For Desert Chlorella(Chlorellasp.TLD6B)Proteome
	牟云; 汪文伦; 严国; 王会敏; 高剑峰
来源期刊	西北植物学报
ISSN	1000-4025
出版年	2016
卷号	36 期号:9 页码:1905-1911
中文摘要	为建立适用于小球藻(Chlorellasp.TLD6B)蛋白质组分析的双向电泳体系,该研究比较了TCA/丙酮沉淀法和Trisol提取法对小球藻蛋白的提取效果,不同pH梯度IPG胶条(pH3~10和pH4~7)、不同蛋白质上样量、不同聚焦程序对小球藻蛋白的分离效果。结果表明:(1)采用Trisol提取法可获得较高纯度蛋白,当选择24cm pH 3~10的线性IPG胶条时,上样量为500mug,聚焦80 000Vh效果最佳,可分辨蛋白点达726个;当选择24cm pH 4~7的线性IPG胶条时,上样量为1 000mug,聚焦80 000Vh效果最佳,可分辨蛋白点达1 230个。(2)该实验随机挑选了10个胶内蛋白点进行MALDI-TOF/TOF-MS鉴定分析表明,其中8个蛋白点鉴定成功,进一步说明Trisol提取法可适用于小球藻双向电泳分析。
英文摘要	In order to establish a two-dimensional gel electrophoresis(2D-E)protocol for proteomic study of desert chlorella(Chlorella sp.TLD6B),we compared the performances of protein extraction methods from desert chlorella betweenTCA/acetone precipitation method and Trisol extraction.The chose pH gradient gel strips and protein loading volume were also optimized.Our results showed that:(1)trisol extraction could obtain high pure protein.The improved 2-DE system for desert chlorella was come out as follows: we distinguished 726 proteins with linear IPG strips of 24cm in length with the pH ranges from 3to 10,500mug loading volume,80000Vh of IEF time.We distinguished 1230 proteins with linear IPG strips of 24 cm in length with the pH ranges from 4 to 7,1 000mug loading volume,80 000Vh of IEF time.(2) Ten randomly selected protein spots were identified by using MALDI-TOF/TOF-MS to confirm the establishment of two-dimensional electrophoresis protocol could be used for primary analysis of desert chlorella proteome.
中文关键词	小球藻 ; 双向电泳 ; Trisol提取法
英文关键词	Chlorella two-dimensional gel electrophoresis(2D-E) Trisol extraction
语种	中文
国家	中国
收录类别	CSCD
WOS类目	BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY
WOS研究方向	Biochemistry & Molecular Biology
CSCD记录号	CSCD:5822473
来源机构	石河子大学
资源类型	期刊论文
条目标识符	http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/235162
作者单位	石河子大学生命科学学院, 石河子, 新疆 832000, 中国
推荐引用方式 GB/T 7714	牟云,汪文伦,严国,等. 沙漠小球藻的蛋白双向电泳分析[J]. 石河子大学,2016,36(9):1905-1911.
APA	牟云,汪文伦,严国,王会敏,&高剑峰.(2016).沙漠小球藻的蛋白双向电泳分析.西北植物学报,36(9),1905-1911.
MLA	牟云,et al."沙漠小球藻的蛋白双向电泳分析".西北植物学报 36.9(2016):1905-1911.