干旱区生态环境知识资源中心(Arid): 玉米耐深播相关性状的全基因组关联分析

Arid

	玉米耐深播相关性状的全基因组关联分析
其他题名	Genome-Wide Association Analysis of Deep-Planting Related Traits in Maize
	陈芳; 张进艳; 李亮; 马艺文; 王振萍; 段运平; 郝转芳
来源期刊	作物杂志
ISSN	1001-7283
出版年	2014
期号	2 页码:43-47
中文摘要	在干旱、半干旱地区,培育耐深播玉米品种对于玉米生产有十分重要的意义。对165份玉米自交系中胚轴长等耐深播相关性状进行调查,结合平均分布于玉米基因组的41 101个单核苷酸多态性(SNP)标记进行全基因组关联分析,筛选出5个与性状显著关联的SNP(P < 0. 0001),分别位于染色体bin10.03和bin5. 04。对候选基因分析发现,其中4个SNP 编码产物分别为酰基载体蛋白、含plus-3结构域蛋白、含FAD 结构域蛋白和过氧化物酶亚家族蛋白。研究将为耐深播性状相关基因的克隆奠定基础。
英文摘要	Breeding maize varieties of deep-planting has very important practical significance in arid and semiarid regions. In this study,the related traits in a panel of 165 maize inbred lines were detected at germination stage,and used to perform the genome-wide analysis using 41 101 SNP of MaizeSNP50 BeadChip. A total of five SNPs were found to be significantly associated with the related traits at a threshold of P < 0. 0001,among which three SNPs were on chromosome bin 10. 03,two on chromosome bin 5. 04. Meanwhile,four candidate genes were scanned: encoding acyl carrier protein (ACP4),plus-3 domain-containing protein,FAD binding domain-containing protein and peroxidase superfamily protein,respectively. These identified genes and SNPs will lay a foundation for cloning deepplanting genes in maize.
中文关键词	玉米 ; 耐深播 ; 中胚轴 ; 全基因组关联分析 ; 候选基因
英文关键词	Maize Deep-planting Mesocotyl Genome-wide association analysis Candidate gene
类型	Article
语种	中文
国家	中国
收录类别	CSCD
WOS类目	Agriculture
WOS研究方向	Agriculture
CSCD记录号	CSCD:5127472
资源类型	期刊论文
条目标识符	http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/232335
作者单位	陈芳, 山西大学生物工程学院, 太原, 山西 030000, 中国.; 张进艳, 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081, 中国.; 李亮, 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081, 中国.; 马艺文, 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081, 中国.; 王振萍, 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081, 中国.; 郝转芳, 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081, 中国.; 段运平, 山西农业科学院作物科学研究所, 太原, 山西 030000, 中国.
推荐引用方式 GB/T 7714	陈芳,张进艳,李亮,等. 玉米耐深播相关性状的全基因组关联分析[J],2014(2):43-47.
APA	陈芳.,张进艳.,李亮.,马艺文.,王振萍.,...&郝转芳.(2014).玉米耐深播相关性状的全基因组关联分析.作物杂志(2),43-47.
MLA	陈芳,et al."玉米耐深播相关性状的全基因组关联分析".作物杂志 .2(2014):43-47.