干旱区生态环境知识资源中心(Arid): 荒漠长耳跳鼠肠道菌群多样性初探

Arid

	荒漠长耳跳鼠肠道菌群多样性初探
其他题名	Initial Analysis of the Intestinal Bacteria Diversity in Desert Euchoreutes naso
	张哲; 孔艳; 尹彦强; 刘斌
来源期刊	干旱区研究
ISSN	1001-4675
出版年	2014
卷号	31 期号:6 页码:1115-1120
中文摘要	长耳跳鼠(Euchoreutes naso)是世界自然保护联盟定义的濒危物种,对长耳跳鼠进行研究和保护极为重要,特别是其肠道微生物多样性的研究对该物种有极大的保护价值。通过提取粪便样品总DNA,构建16S rRNA 文库,基于核苷酸片段多态性的分析方法,利用内切酶Bsur I 对262个克隆子进行酶切分型、测序后得到15种不同的可操作分类单元,对该可操作单元进行基本局部比对工具(basic local alignment search tool,BLAST)比对后,得到梭菌目(Clostridiales)、乳杆菌目(Lactobacillales)、肠杆菌目(Enterobacteriales)、芽孢杆菌目(Bacillales)、拟杆菌目(Bacteroidales)、支原体目(Mycoplasmatales)6个目的细菌种类。
英文摘要	Euchoreutes naso is defined as an endangered species by International Union for Conservation of Nature(IUCN). It is important to do the research and protection with Euchoreutes naso. Study of its intestinal microbial diversity has highly conservation value. Seventeen sequences were obtained through extracting the total DNA, building 16S rRNA clone libraries,analyzing the nucleotide fragment length polymorphism which was digested by Endonuclease Bsur I within 262 clones and sequencing the different operational taxonomic units. After Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)aligned,six orders of the gained species were obtained,which were Clostridiales, Lactobacillales,Enterobacteriales,Bacillales,Bacteroidales and Mycoplasmatales. Therefore,the phylogenetic tree could show a visual result.
中文关键词	长耳跳鼠(Euchoreutes naso) ; 肠道微生物 ; 菌群多样性 ; 系统发生树
英文关键词	16S rRNA Euchoreutes naso intestinal microbes microbial diversity phylogenetic tree 16S rRNA
语种	中文
国家	中国
收录类别	CSCD
WOS类目	ENVIRONMENTAL SCIENCES
WOS研究方向	Environmental Sciences & Ecology
CSCD记录号	CSCD:5293930
来源机构	中国科学院新疆生态与地理研究所
资源类型	期刊论文
条目标识符	http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/231189
作者单位	中国科学院新疆生态与地理研究所, 荒漠与绿洲生态国家重点实验室, 乌鲁木齐, 新疆 830011, 中国
推荐引用方式 GB/T 7714	张哲,孔艳,尹彦强,等. 荒漠长耳跳鼠肠道菌群多样性初探[J]. 中国科学院新疆生态与地理研究所,2014,31(6):1115-1120.
APA	张哲,孔艳,尹彦强,&刘斌.(2014).荒漠长耳跳鼠肠道菌群多样性初探.干旱区研究,31(6),1115-1120.
MLA	张哲,et al."荒漠长耳跳鼠肠道菌群多样性初探".干旱区研究 31.6(2014):1115-1120.