干旱区生态环境知识资源中心(Arid): 西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析

Arid

	西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析
其他题名	Bioinformatics analysis of ribosomal protein gene of JWB phytoplasma in the northwestern arid regions
	吴宽 1; 颜永杰 2; 王海妮 3; 张珏 3
来源期刊	干旱地区农业研究
ISSN	1000-7601
出版年	2010
卷号	28 期号:3 页码:265-268
中文摘要	枣疯病是枣树上的一种具有毁灭性的植原体病害,几乎分布于国内所有的枣树栽培区,造成了巨大的经济损失.对我国陕西,宁夏,甘肃3省枣疯病样品植原体核糖体蛋白基因进行克隆和测序,获得枣疯病植原体的核糖体基因片段为1 196bp,包含部分rps19, rpl22和rps3三个基因,其中rpl22和rps3大小分别354bp和753bp,分别编码118和251个氨基酸,且这两个基因为非重叠基因.序列同源性比较结果表明:我国陕西,宁夏,甘肃的枣疯病植原体的核糖体蛋白rp基因大小一致,归属于植原体16SrⅤ-B组;该植原体核糖体蛋白基因特性与樱桃致死黄化(CLY5)和桃树黄化印度分离株系(PY-In)植原体相似.首次报道了我国枣疯病核糖体蛋白基因rp基因的序列,把枣疯病植原体归到16SrⅤ-B组,为枣疯病植原体提供了新的分类依据
英文摘要	Jujube witches’ broom(JWB) is a destructive disease caused by phytoplasma, that happened almost in every cultural regions at home and abroad, bringing large economic loss. The ribosomal protein(rp) gene is cloned by polymerase chain reaction from the samples of JWB which were collected from Shaanxi, Ningxia and Gansu. After sequenced,it is found that rp gene is 1199 bp, which included partial rps19, rpl22 and rps3.rpl22 and rps3 coded 129 and 252 amino acids respectively, and these two genes are not overlapped. The homologic analysis shows that pathogens from Shaanxi, Ningxia and Gansu are same;and it is similar in character among JWB, cherry lethal yellows and peach yellows isolate PY-In phytoplasmas. This study reports rp sequences of JWB phytoplasmas for the first time and identifies that JWB phytoplasma belongs to 16S rⅤ-B, which can provide theory basis for research of the functional sec system of JWB phytoplasma
中文关键词	枣疯病,植原体 ; 核糖体蛋白基因 ; 序列分析 ; 生物信息学
英文关键词	jujube witches’ broom phytoplasma ribosomal protein gene sequence bioinformatics
语种	中文
国家	中国
收录类别	CSCD
WOS类目	HORTICULTURE
WOS研究方向	Agriculture
CSCD记录号	CSCD:4057395
来源机构	西北农林科技大学
资源类型	期刊论文
条目标识符	http://119.78.100.177/qdio/handle/2XILL650/224953
作者单位	1.西北大学信息科学与技术学院, 西安, 陕西 710069, 中国; 2.西北大学生命科学学院, 西安, 陕西 710069, 中国; 3.西北农林科技大学植物保护学院, 陕西省农业分子生物重点实验室, 杨凌, 陕西 712100, 中国
推荐引用方式 GB/T 7714	吴宽,颜永杰,王海妮,等. 西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析[J]. 西北农林科技大学,2010,28(3):265-268.
APA	吴宽,颜永杰,王海妮,&张珏.(2010).西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析.干旱地区农业研究,28(3),265-268.
MLA	吴宽,et al."西北旱区枣疯病植原体核糖体蛋白基因的生物信息学分析".干旱地区农业研究 28.3(2010):265-268.