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Arid

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NGS-Indel Coder: A pipeline to code indel characters in phylogenomic data with an example of its application in milkweeds (Asclepias) 期刊论文
发表期刊: MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION. 出版年: 2019, 卷号: 139
作者:  Boutte, Julien;  Fishbein, Mark;  Liston, Aaron;  Straub, Shannon C. K.
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Sub-sampling  SNP detection  Incomplete lineage sorting  Apocynaceae  Character coding  Gene tree filtering  
Evolution at the tips: Asclepias phylogenomics and new perspectives on leaf surfaces 期刊论文
发表期刊: AMERICAN JOURNAL OF BOTANY. 出版年: 2018, 卷号: 105, 期号: 3, 页码: 514-524
作者:  Fishbein, Mark;  Straub, Shannon C. K.;  Boutte, Julien;  Hansen, Kimberly;  Cronn, Richard C.;  Liston, Aaron
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ancestral state reconstruction  Apocynaceae  data partitioning  evolutionary trend  leaf epidermis  model of character evolution  milkweed  plastid genome  stochastic character mapping  water-use efficiency  
Dissertation Research: Turning Vines Into Trees: A Genome Skimming Approach to the Phylogenetics of New World Milkweed VInes (Matelea, subg. Chthamalia, Apocynaceae) 项目
项目编号: 1311170. 资助机构: US-NSF（美国国家科学基金会）. 起止日期: 2013-2016
负责人:  Mark Fishbein
收藏  |  浏览/下载：8/0  |  提交时间：2021/01/13
NAVIGATING THE TIP OF THE GENOMIC ICEBERG: NEXT-GENERATION SEQUENCING FOR PLANT SYSTEMATICS 期刊论文
发表期刊: AMERICAN JOURNAL OF BOTANY. 出版年: 2012, 卷号: 99, 期号: 2, 页码: 349-364
作者:  Straub, Shannon C. K.;  Parks, Matthew;  Weitemier, Kevin;  Fishbein, Mark;  Cronn, Richard C.;  Liston, Aaron
收藏  |  浏览/下载：13/0  |  提交时间：2019/11/29
Asclepias  chloroplast content  genome skimming  Illumina  next-generation sequencing  low-copy nuclear gene  plant systematics  plastome  reference-guided assembly  ribosomal DNA cistron